--> PON さん
うーん、カードは認識できて、中は見えるんですね。
幸いにして、そういうトラブルにあったことがないので、正確かどうかわかりませんが、
いわゆる復元ソフトで破損データを復元して、HDDにそのデータを避難させて、CFをいきなりフォーマットしないでデータを空にする。その後カメラでフォーマットをかける。というのはどうなんでしょう。
デスクトップの外付リーダーではうまくいかないときがあるので、ノート所有なら、ノートのカードスロットに入れて行うと確率が上がるとか、、、
それもだめなら、私も力添えをすることはできません。復元を扱う業者もいるようです。そうなるとコストのからみが出てくるし、詳しくもないので、お調べになってください。「データ」「復旧」で検索かけると出てくるはずです。