≫ ４０ＵＳＥＲ さん おはようございます
> 「このメディアは初期化されていません。初期化しますか？」タイトルの
> メッセージが現れました。
>
上記メッセージの後メディアへの再アクセスは試されたのでしょうか？
メッセージ自体は、カメラ側がメディアのフォーマットを読み取れなかったということなので、
１．電源を入れなおす
２．メディアを入れなおす
３．他の機器（他のカメラやPCなど）
などの方法で正常に使える場合がけっこうあります。３の場合では、カードリーダーを変えたら読めたりすることもありますね。
すでにこういった試行をされてみてメディアの不具合の可能性が高いのでファイルの復旧をしたいのでしょうか？
データの破損の場合ソフト等で救済できることがあるのはすでにレスされていますが、カードそのものが壊れている時には記録領域に残ったデータをすい出せるかどうかメーカーに問い合わせてみてください。
いずれにせよメッセージが出た後どうしてどーなったかわからないので推測だけでの答えになってしまってすいません。
メッセージが出た理由も、本体の不具合メディアの不具合本体とメディアの相性が悪かったなど色々あると思いますので、お使いの製品やその後の状況など詳しい情報を追加されるといいと思います。